Υπόθεση: Ο Μικελάντζελο, ο Ντονατέλο, ο Λεονάρντο και ο Ραφαέλ επιστρέφουν για να τα βάλουν με μεγαλύτερους κι ακόμα πιο επικίνδυνους κακοποιούς, έχοντας στο πλευρό τους την Έιπριλ Ο’Νιλ (Μέγκαν Φοξ), τον Βερν Φένγουικ (Γουίλ Αρνέτ) και τον «νέο»: τον εκδικητή με τη μάσκα του χόκεϊ που ακούει στο όνομα Κέισι Τζόουνς (Στίβεν Αμέλ). Αφού δραπετεύει, ο Σρέντερ ενώνει τις δυνάμεις του με έναν τρελό επιστήμονα, τον Μπάξτερ (Τάιλερ Πέρι) και δύο μπράβους της κακιάς ώρας, τον Μπίμπομπ (Γκάρι Άντονι Γουίλιαμς) και τον Ρόκστεντι για να βάλουν σε εφαρμογή ένα διαβολικό σχέδιο κατάκτησης του κόσμου. Ενώ οι Χελώνες ετοιμάζονται να εξοντώσουν τον Σρέντερ και τη νέα του ομάδα, βρίσκονται αντιμέτωποι με έναν ακόμα μεγαλύτερο κακοποιό που έχει ανάλογες προθέσεις: τον διαβόητο Κρανγκ.
Η επανεκκίνηση της «μεταλλαγμένης» τηλεοπτικής σειράς που έγινε πέρσι ταινία – και πολύ μεγάλη εμπορική επιτυχία – συνεχίζεται το επόμενο καλοκαίρι, με τα Χελωνονιντζάκια να καλούνται να σώσουν για άλλη μια φορά τη Νέα Υόρκη και τον κόσμο από μια καινούργια θανάσιμη απειλή.
