Η οικονομική μελέτη της Προγραμματικής Σύμβασης μεταξύ του Δήμου Κηφισιάς, της Περιφέρειας Αττικής και του Υπουργείου Πολιτισμού, για την αποκατάσταση της Βίλας Κουτούπη, ώστε να μετατραπεί σε μουσείο και να στεγάσει τη Αρχαιολογική Συλλογή Κηφισιάς, έγινε αντικείμενο συζήτησης στο Περιφερειακό Συμβούλιο Αττικής και στο Δημοτικό Συμβούλιο Κηφισιάς.
Με αφορμή και τη σχετική ανακοίνωση της επικεφαλής της δημοτικής παράταξης ΠΟΛΗ ΦΩΣ Αγγελικής Συνοδινού, η οποία έκανε λόγο για «αδιαφάνεια» σχετικά με τον προϋπολγισμό των εργασιών, ο Δήμος Κηφισιάς εξέδωσε δελτίο Τύπου με την αναλυτική τους κοστολόγηση.
Στο επίκεντρο του ενδιαφέροντος, ο προϋπολογισμός των 250.000 ευρώ για εργασίες εντός της Βίλας Κουτούπη, αλλά και για τη δημιουργία βοηθητικών κτηριακών υποδομών λειτουργίας του νέου μουσείου. Ο Δήμος Κηφισιάς, με απόφασή του στις 14/4/2010, έχει παραχωρήσει για τα επόμενα 99 χρόνια στο υπουργείο Πολιτισμού την όλη λειτουργία του νέου μουσείου. Το νέο σχέδιο προγραμματικής σύμβασης συντάχθηκε από τη Γενική Γραμματεία Πολιτισμού και παραδόθηκε προς έγκριση και υπογραφή στα άλλα δυο ενδιαφερόμενα μέρη, τον Δήμο Κηφισιάς και την Περιφέρεια Αττικής.
Και αν στο Δημοτικό Συμβούλιο Κηφισιάς εγκρίθηκε με συνοπτικές διαδικασίες η προγραμματική σύμβαση, στο Περιφερειακό Συμβούλιο Αττικής διατυπώθηκαν πολλά ερωτηματικά, καθώς δεν υπήρχε αναλυτική τεχνική έκθεση των εργασιών, που κοστολογούνται σε 250.000 ευρώ. Η σύμβαση προβλέπει ως συμβαλλόμενο μέρος και την Περιφέρεια Αττικής, με στόχο την παρακολούθηση του φυσικού και οικονομικού αντικειμένου, την παροχή κάθε αναγκαίας πληροφορίας και τη συμμετοχή εκπροσώπου της στην κοινή επιτροπή παρακολούθησης. Όλα αυτά, χωρίς την οικονομική συνδρομή της.
Το κόστος μεταστέγασης της Αρχαιολογικής Συλλογής θα αναλάβει εξ ολοκλήρου ο Δήμος Κηφισιάς. Ο εισηγητής, αντιπεριφερειάρχης Βορείου Τομέα Αθηνών, Κωνσταντίνος Μανιάτης, ζήτησε εν τέλει την αναβολή του θέματος, προκειμένου να κατατεθεί αναλυτική κοστολόγηση των προϋπολογιζόμενων εργασιών.
Ο δήμαρχος Κηφισιάς, ο οποίος παραβρέθηκε στη συνεδρίαση του Περιφερειακού Συμβουλίου, εξήγησε το κατεπείγον του θέματος, καθώς ο νέος ιδιοκτήτης του κτηρίου που ανήκε προηγουμένως στον Ερυθρό Σταυρό και στεγάζει μέχρι σήμερα την Αρχαιοολογική Συλλογή Κηφισιάς έχει δώσει «τελεσίγραφο» για την εκκένωση του χώρου. Ο κ. Χιωτάκης δεσμεύθηκε ότι ο Δήμος Κηφισιάς, την επομένη κιόλας μέρα, θα έστελνε αναλυτικά τεχνικά και οικονομικά στοιχεία, τα οποία δεν είχαν ζητηθεί εξ αρχής. Έπειτα και από την παρέμβαση του περιφερειάρχη Αττικής Γιάννη Σγουρού, ο οποίος τάχθηκε κατά της αναβολής, το θέμα έγκρισης σκοπιμότητας σύναψης και όρων της προγραμματικής σύμβασης εγκρίθηκε κατά πλειοψηφία από το Περιφερειακό Συμβούλιο Αττικής.